El tratado titulado El origen de las palabras, la filosofía y la religión, que aquí se presenta, constituye la Segunda parte del Libro de las letras. En él se expone una historia de la construcción social del conocimiento desde los estadios más primitivos a los más avanzados, prestando una especial atención al lenguaje (matriz de este desarrollo), al estudio de las diferentes formas de razonamiento y a la construcción social del saber. A partir de aquí, Al-Farabi investiga la aparición de las filosofías y las religiones, los argumentos en que se basan, las funciones que cumplen y los trasvases y conflictos que pueden surgir entre las mismas. Resultado de este estudio es la afirmación de la universalidad de la razón, facultad que permite el entendimiento entre hombres provenientes de religiones distintas y hace posible la crítica de los elementos retrógrados que hay en cada tradición. El pensamiento de Al-Farabi, contemporáneo de la edad de oro del Islam clásico, nos ofrece, por primera vez, un sistema completo de la filosofía árabe con todos sus temas centrales bien perfilados, en cuya estela trabajarán figuras como Avicena o Averroes.