Cuando Josh y Sophie, dos adolescentes que viven en San Francisco,  deciden ponerse a trabajar en una librería en verano para sacarse un poco de dinero, no se imaginan que los afables propietarios, Nicolas Flamel y Peronelle, son los últimos guardianes de un libro mágico y milenario: un antiguo volumen que esconde entre sus páginas los más profundos secretos de la civilización y el funcionamiento del mundo. Ahora este libro ha sido robado, la esposa de Flamel ha desaparecido, y ellos desearán recuperarlo antes de que sea demasiado tarde...