La Tierra, año 3404 d.c. Nuestro planeta está a punto de morir. Los humanos se han encerrado en el subsuelo, donde han creado las Ciudades Eternas. En yamato, Masato Yamanobe, un piloto especial de segunda clase, convive con Tamami, una Moppie. Lock, uno de sus superiores, ordena a Masato que la elimine. Pero Masato la ama demasiado, y escoge el camino difícil: huir. Finalmente, decide salir al exterior para sobrevivir.